Nemcsak Magyarországon, de a kelet-közép-európai régióban is egyedülálló az a genetikai analizátor, amely immár gyorsan és olcsón képes elvégezni például DNS-vizsgálatokat. Az új rendszer a Növénygenomikai,
Humán Biotechnológiai és Bioenergiai Intézetben működik, s a világszínvonalú kutatások mellett „hétköznapi” megrendelői igényeket is készek teljesíteni a munkacsoport tagjai. Olyan intézmények, vállalkozások – sőt magánszemélyek – megbízását is várják, amelyek, akik például a genetikai betegségek kimutatását, fertőzések diagnosztizálását, kórokozók azonosítását, két egyed közötti rokonsági fok meghatározását, személy-azonosítást, oltóanyag-fejlesztést, nemesítést vagy génváltozatok összehasonlítását kérik.
Az igencsak fiatal tudományág, a genomika magasfokú és minden eddiginél precízebb művelésére alkalmas az a legkorszerűbb, összetett informatikai megoldásokat alkalmazó újgenerációs szekvenáló (Next Generation Sequencing, angol rövidítéssel NGS) műszeregyüttes, amelynek segítségével szerteágazó biológiai minták vizsgálatára – a mikroorganizmusok filogenetikai törzsfáinak vizsgálatától a gének kópiaszámának megállapításáig – nyílik lehetőség. A rendszer legfőbb erősségei az ultramagas teljesítmény és a páratlan pontosság. E berendezésből jelenleg a kelet-közép-európai régióban egy van, méghozzá Szegeden, a Növénygenomikai, Humán Biotechnológiai és Bioenergiai (BAYGEN) Intézetben, amely a Bay Zoltán Alkalmazott Kutatási Közalapítvány legfiatalabb tagja.
A genomika – amely már betört a mindennapi orvoslásba is – hihetetlenül gyorsan fejlődik. Ennek bizonyítéka, hogy míg az emberi genom feltárására egy korábbi módszerrel az 1990-es évek elején kezdtek hozzá és 2001-ben fejezték be, addig – az új biotechnológiai eszközrendszer alkalmazásával – manapság néhány hét alatt megoldható ugyanaz a vizsgálat: a több mint hárommilliárd bázispár sorrendjének megállapítása. Ezt, vagyis a teljes genom szintű vizsgálatok legkorszerűbb szekvenciameghatározását az NGS-technológia teszi lehetővé. E forradalmian új genetikai analizátor-platform üzembe állítása dr. Nagy István kutatási munkacsoport-vezető irányításával történt, ezért is kértük, hogy az itthon és a régiónkban egyedülálló műszeregyüttes hasznosságát foglalja össze.
A kutató rövid értékelésében kifejtette: a genomikai megközelítés bevezetése a molekuláris biológiába radikálisan átalakította napjaink kísérletes biológiáját, és lehetővé tette az élő rendszerek molekuláris működésének gyorsabb, átfogóbb megismerését. Ennek részeként az NGS-technológia, ultramagas áteresztőképességének – vagyis annak, hogy egyetlen kísérlet milliónyi szekvenciát eredményez – köszönhetően egyre gyorsabban szorítja ki a korábbi lassúbb és drágább technológiákat.
Az NGS-technológia előnyei közé tartozik még, hogy a vizsgálni kívánt szekvenciákat nem feltétlenül kell ismerni, a paralóg szekvenciák könnyedén megkülönböztethetőek egymástól, a kvantitálás valóban mennyiségi alapon történik. Ez utóbbi paraméter miatt az NGS-szekvenálásokat nem szükséges három biológiai replikátummal elvégezni, s ebből is adódóan a kísérlet költségei jelentősen csökkennek. Az NGS-technológia legfőbb alkalmazási területei a génexpresszió-mérés, a genotipizálás, a DNS-metilációs mintázat feltárása, a transzkripciós faktor-kötőhely azonosítás, új SNP-k és mikroRNS-ek tömeges azonosítása, valamint alkalmas új, eddig nem ismert fajok azonosítására is (metagenomika).
Az NGS-technológia minden nukleinsav alapú (DNS vagy RNS) molekulát képes meghatározni, ezekkel pedig szinte mindegyik kutató-, diagnosztikus és igazságügyi laboratórium dolgozik. A technológiának
a jövőben meghatározó szerepe lesz az orvostudomány, a tudományos kutatások, a bűnüldözés, az archeológia és minden olyan tudományterület továbbfejlődésében, amely az örökítőanyag vizsgálatának gyakorlatát alkalmazza, ám az intézményi vagy a személyes vizsgálati és/vagy kutatási igényeket a BAYGEN és együttműködő partnerei, a SeqOmics Kft. és az Astrid Research Kft. már most képesek teljesíteni.
SeqOmics Biotechnológia Kft.
Honlap: www.seqomics.hu
Astrid Research Kft.
Honlap: www.astrid.hu
Bay Zoltán Alkalmazott Kutatási
Közalapítvány
Növénygenomikai, Humán Biotechnológiai és Bioenergiai Intézetet
Honlap: www.baygen.hu
|